Система GeneChip™ Scanner 3000 – наиболее универсальное решение Affymetrix для молекулярного кариотипирования, анализа единичных полиморфизмов (SNP) и копийности генов (CNV), профилирования экспрессии генов, определение фармакогенетических маркёров.
Система GeneChip™ Scanner 3000 7G включает в себя всё необходимое для проведения исследований - от комплектов реагентов и гибридизационных чипов до оборудования и комплексного программного обеспечения:
Гибридизационная камера Hybridization Oven 645;
Блок для отмывки микрочипов Fluidics Station 450;
Сканер микрочипов GeneChip® Scanner 3000 7G;
Компьютерная станция с монитором и управляющим ПО;
Программное обеспечение для для анализа данных;
ПО для управления процессом обработки чипов и анализа данных.
В системах серии GeneChip™ Scanner 3000 7G используются классические микрочипы Affymetrix. Это наиболее используемый формат гибридизационных чипов во всем мире.
Наименование |
Описание |
CytoScan HD Array Kit and Reagent Kit Bundle |
Affymetrix CytoScan HD используется для комплексной цитогенетической диагностики, позволяющее детектировать инсерции и делеции, вариации копийности фрагментов ДНК (CNV), потери гетерозиготности (LOH), однородительские дисомии (изодисомии), мозаицизм, однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), анеуплоидии и другие хромосомные аберрации. Суммарное количество маркеров 2,7 млн. |
CytoScan 750K Array Kit and Reagent Kit Bundle |
Affymetrix CytoScan 7560K используется для комплексной цитогенетической диагностики, позволяющее детектировать инсерции и делеции, вариации копийности фрагментов ДНК (CNV), потери гетерозиготности (LOH), однородительские дисомии (изодисомии), мозаицизм, однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), анеуплоидии и другие хромосомные аберрации. Суммарное количество маркеров 750 000. |
OncoScan™ FFPE Assay Kit |
Микрочипы для полногеномного профилирования изменения копийности генов (CNV) и потери гетерозиготности (LOH) образцов солидных опухолей при крайне малом количестве образцов и сильно деградированной ДНК из парафинизированных FFPE образцов. |
GeneChip®Human Transcriptome Array 2.0 |
Микрочипы для анализа транскриптов человека. Беспрецедентно широкий охват >245 000 кодирующих транскриптов и >40 000 некодирующих. По глубине покрытия аналог глубокого секвенирования (deep RNA-seq) на высокопроизводительных NGS секвенаторах. |
Human Gene ST Arrays |
Новый микрочип для полнотранскриптомного анализа кодирующих (mRNA) и некодирующих (lincRNA) транскриптов человека. Кол-во кодирующих >30 000, некодирующих >11 000. |
Mouse Gene ST Arrays |
Микрочип для полнотранскриптомного анализа экспрессии генов мыши. Тестирование более 27 000 генов мыши. |
Rat Gene ST Arrays |
Микрочип для полнотранскриптомного анализа экспрессии генов крысы. Тестирование более 28 000 генов крысы. |
Model and applied research organisms Gene 1.0 ST Array |
Микрочипы для полнотранскриптомного анализа экспрессии генов следующих организмов: |
miRNA Array |
Микрочипы для анализа микро-РНК. 100% покрытие базы данных miRBase. Более 200 организмов. |
PrimeView™ Human Gene Expression Array |
Самое экономичное решение для профилирования экспрессии генов человека. Тестирование только аннотированных транскриптов. Более 36 000 транскриптов и их вариантов. |
Human Genome U133 Plus 2.0 Array |
Микрочипы для профилирования экспрессии генов человека. Большая часть работ в мире с анализом транскриптов была сделана с использованием 133-й серии чипов Affymetrix. Количество публикаций >6000. Используется для поиска новых регуляторных путей, валидации лекарственных мишеней, понимания механизма апоптоза, анализа токсикологического ответа, поиска ключевых биомаркёров. |
Mouse Genome 430 2.0 Array |
Микрочипы для анализа экспрессии генов мыши. Тестирование более 39 000 транскриптов. |
Rat Genome 230 2.0 Array |
Микрочипы для анализа экспрессии генов крысы. Тестирование более 30 000 транскриптов. |
Genome-Wide Human SNP Array 6.0 |
Микрочип Genome-Wide Human SNP 6.0 Array для SNP-генотипирования и анализа копийности генов человека. Тестирование более 1,8 млн маркеров. |
DMET Plus Solution |
Микрочипы для профилирования маркёров лекарственного метаболизма. |
Источник излучения |
твердотельный лазер |
Длина волны возбуждения, нм |
532 |
Длина волны детекции, нм |
570 |
Разрешение, мкм |
1,56 |
Чувствительность |
<0,5 флуорофор/мкм2 |
Время сканирования микрочипа, мин |
5-10 (в зависимости от формата чипа) |
Цифровое разрешение |
16 bits |
Операционная система |
Windows XP |
Габариты, мм |
330 x 560 x 460 |
Вес, кг |
32; 45,5 (с автозагрузчиком) |