Серьезной проблемой для профессионалов и любителей является нежелательное появление в аквариуме низших растений, засоряющих водное пространство: «черной бороды», нитчатки, сине-зеленых водорослей. Простейшие растения нарушают жизнедеятельность высших растений, уменьшая способность последних к ассимиляции. Расползаясь по стенкам водоема, вредоносные водоросли перекрывают доступ жизненно необходимого света к высшим растениям, являющимся частью экологической системы аквариума. В результате активного распространения водорослей происходит выделение в воду ядовитых веществ, становится меньше кислорода и сильно меняются химические показатели воды. Для борьбы с опасными жителями применяются химические средства, скребки и даже рыбки – сомики. Эти приемы часто не срабатывают, и аквариум превращается в сплошное зеленое пятно.